可能です。
例えば、シンセ音を MAIN OUTPUT から、RETURN 端子に入力された音を SUB OUTPUT から出力する場合は、SYNTH/FX 画面で THRU/RTN と OUTPUT MIXER の間に SUB OUT（SUB） を移動させて、OUTPUT MIXER 画面で RETURN LEVEL を 0 に設定してください。
※ 「ライン出力する場合に、ギター・サウンドのみにアンプ・シミュレーターを通して、シンセ・サウンドにはアンプ・シミュレーターを通さない設定」、「MAIN OUTPUT 端子からはギター・サウンドのみ、SUB OUTPUT 端子からはシンセ・サウンドのみを出力する設定」 については、SY-300 パラメーターガイド／サウンド・リスト 『SY-300 の出力を設定する』 の項をご参照ください。
■ SY-300 パラメーター・ガイド／サウンド・リスト