できます。
S-4000R リモート・コントローラーを使えば、 S-4000S のインプット・チャンネルごとのプリアンプ・ゲイン、ファンタム電源、パッド設定を保存し、呼び出すことができます。（メモリー数： 10）
（※ S-4000S 単体では、インプット・チャンネルの設定を保存することはできません。）
また、S-4000 リモート・コントロール・ソフトウェア（ S-4000 RCS ）を使って、コンピューターからコントロールした場合でも、上記の設定を保存し、呼び出すことができます。
ご参考：
S-4000RCS の場合には、4 つのデジタル・スネイク・システムを同時にコントロールできます。その全ての設定を 100ヶ まで記憶でき、これを MEMORY と区別して SCENE と読んでいます。もちろん、MEMORY の RECALL/STORE も S-4000RCS からリモート可能です。
また、S-4000RCS の 100ヶ の SCENE は 1 つのファイルとなっています。このfile は コンピューターのハードディスクの容量の許す限り作ることができるので、ほぼ無限の記憶ができることになります。